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情况功效基因组Functional Gene Arrays

产物简介

PathoChip是周集合传授及其团队于2013年胜利研发的针对病原微生物的功效基因芯片,用于检测多种情况傍边病原和与致病相干的微生物群落的功效构成和布局,进而切磋和评价要挟人类和动动物安康的微生物群落的致病潜能。
该芯片针对16,762个确认的致病和毒性相干基因序列,共设想了3,715个探针,特同性检测1,397个病原微生物物种(2,336个菌株)中7,417个卵白编码序列,共涵盖了13个关头的致病和毒性因子。

产物上风

  • 数据可读性强

    与基于测序的宏基因组数据比拟,GeoChip数据简略易懂,可间接用于各种统计阐发,有助于成果的解读和比拟

  • 活络度和靠得住性高

    该芯片已对泥土、海水和人体唾液样品停止了尝试测试,成果标明,平行样品间成果具备很高重现性

  • 宿主基因组的搅扰少

    PathoChip芯片是按照病原微生物相干的各种功效基因设想的特同性探针,可专注地检测单个特定的功效(序列)

  • 检测类群广

    PathoChip芯片所针对的病原微生物群落功效非常周全,包含了如附着、定植、迁徙、入侵、毒性、免疫逃走和铁离子摄取等相干的多种病原微生物

尝试流程

  • 样品收罗

  • 核酸(DNA/RNA)提取

  • 核酸检测

  • 荧光标记

  • 芯片杂交

  • 芯片扫描与成像

阐发流程

手艺参数

  • 测试战略

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                DNA或cDNA

                RNA

              • 数据量

                60K/180K

                60K/180K

              • 周期

                55个任务日

                65个任务日