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国际首发| 大发官网云 整合文献数据云阐发!

来历:admin    宣布时候:2022-04-29   浏览数:204

千呼万唤,大发官网云生态全新云数据库终究重磅推出啦!


国际首发| 大发官网云 整合文献数据云阐发!



国际首发!整合整套组学阐发的云文献数据库!

自2021年大发官网云生态(http://cloud.suvs2016.com/)全新进级,现于原有四大焦点板块(【云组学】、【云东西】、【云讲堂】及【云资本】)的根本上,增设了【云数据库】。


今朝普通支流微生物组数据库,于研讨者的角度,所面对的挑衅有如下:

(1)样本信息完全性及挑选查找;

(2)数据库数据整合组学阐发;

(3)阐发可视化品质与操纵性。


以上的诸多挑衅也致使大局部研讨数据仅可一次性操纵,实在惋惜,故大发官网云数据库将完善地处理以上标题题目!操纵者经由过程大发官网云数据库将可以或许等闲停止文献样本数据信息『搜刮』、『过滤』、『整合』及『阐发』,进而大大晋升科研数据的整合再操纵率。


国际首发| 大发官网云 整合文献数据云阐发!


本日!大发官网云生态-微生物组数据库(BioCloud-MicroDB)重磅上线,接上去咱们一起揭开BioCloud-MicroDB的奥秘面纱吧~


一、 文献样本来历散布 

此数据库首要搜集扩增子多样性(16S、18S、ITS)数据,其来历于国际支流数据库(NCBI、Qiita、EMBL等),同时加上了大批的野生归纳汇整数据。今朝该数据库含总计6.3万余例样本,此中人体及泥土相干占70%。


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1、 样本信息 

其所乘载样本信息包罗:测序平台、目标片断、片断选区、样本物种来历、样本取样点、相干疾病、文章标题题目及PubMedID等,可供给线上搜刮查问。


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2、取样点信息 

数据库所涵盖文献触及相干取样点信息散布首要为Gastrointestinal_Tract(胃肠道, 33.9%)、Skin(皮肤, 20.2%)、Soil(泥土, 15.1%)、Oral(口腔,8.4%)等,总计27项(取样点1),並在取样点1的根本下,进一步细化分类取样点2信息(如取样点1 Skin(皮肤),可在取样点2中细分成Arm(手臂)、Foot(脚)、Palm(手掌)等),总计251项。


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3、 疾病范例 

数据库所涵盖触及相干疾病包罗:糖尿病、Crohn’s Disease(CD)、Ulcerative Colitus(UC)、动脉粥状软化、NAFLD及帕金森氏症等总计16项。


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4、 目标片断与测序平台

数据库涵盖16S、18S及ITS,并细化百般本所扩增片断地区如16S V3-V4、16S V4、18S V9、ITS1、ITS2等总计18项。另所涵盖测序平台包罗Illumina HiSeq、MiSeq、NextSeq、LS454及Ion Torrent S5等总计11项细化信息。



二、初心与期盼

大发官网注入诸多血汗搭建大发官网云-微生物组数据库并供给『样本级别的文献信息搜刮』、『整合文献数据与自数据阐发』、『在线SCI级别图片东西调剂』及『共建数据库进步文章援用率』等功效,旨在为一切迷信研讨者供给一个好的阐发平台与进修六合。吾辈将延续秉持初心,供给更专业且切近您们科研需要的办事及东西,同时将倾泻尽力疾速扩大数据库,也盼大师能延续地赐与咱们撑持与鼓动勉励!



三、等候您的分享

如您情愿分享您的数据,接待您扫描下方二维码与咱们接洽,期盼咱们能助力大幅晋升您的数据再操纵性及文章援用率!   


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(http://wj.qq.com/s2/10117120/5536/)







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