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产物进级|原核有参转录组level up

来历:admin    宣布时候:2021-10-29   浏览数:454

大发官网原核有参转录组全新进级、阐发速率、精确度、内容丰硕度均有超大晋升,这次进级为收费增值,加值不加价,真香~


Part1 产物先容

转录组即某个物种或特定细胞在某一功效状况下发生的一切RNA的总和,是研讨细胞表型和功效的一个主要手腕,也是今朝利用最为普遍的测序组学之一。而今朝科研学者对转录组的阐发请求已不只限于获知其基因抒发量和差别情况了,更多将存眷点转移到阐发速率晋升、精确度进步和阐发内容丰硕。大发官网也紧跟各大科研用户的需要,推出了更快更准更品貌的原核有参转录组V2.0,阐发流程咱们先睹为快。


产物进级|原核有参转录组level up


Part2 进级亮点

01、阐发流程提速

基因抒发是做转录组的用户城市存眷的点,今朝大发官网的原核有参转录组V2.0的基因抒发量定量软件改换为salmon,salmon在完成将 read 疾速比对到参考序列的同时接纳了一个新的双相位并行推理算法和功效丰硕的误差模子,能够或许在全转录组程度更精确的预算片断的GC含量偏好,能够明显进步转录本程度抒发品貌估值的精确性和后续差别抒发阐发的活络度。


02、差别阐发进级

基于基因抒发量的差别阐发是今朝经常使用的挑选关头基因的阐发方式,但此方式在默许参数下能够会疏忽一些抒发量差别不明显但功效主要的基因。为了供给更周全的差别阐发成果,原核有参转录组V2.0引入了GSEA的阐发思绪,供给另外一种关头基因的阐发成果,用户们能够按照本身的需要挑选响应的阐发成果持续深切发掘,亦可两部分的成果响应印证。


表1.基于KEGG数据库的GSEA阐发
产物进级|原核有参转录组level up


03、布局阐发内容丰硕

基因的抒发是科研用户重点存眷的内容,但今朝也愈来愈多用户同时存眷基因布局的变更,从不同的角度剖析mRNA的数据。今朝原核有参转录组V2.0增添的布局阐发内容包含:SNP/InDel阐发、支配子阐发、转录/翻译位点阐发、UTR 阐发、启动子序列展望和 sRNA 阐发,完成一份报告知足用户基因抒发量阐发和布局阐发的两个需要。


产物进级|原核有参转录组level up






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